数量分类学（numerical taxonomy），应用数学方法和电子计算机来研究生物分类问题的边缘学科。又称数值分类学。由美国R.R.索卡尔和英国P.H.A.斯尼思于20世纪50年代创立，现已广泛应用于动物、植物和微生物的分类。数量分类学的工作方法大致分为5步。①选择所要研究的单位（如品系或种等），所用最低级的实体称为运算分类单位（OTU＝Operational Taxonomic Unit）。②选择OTU的性状（ 包括形态学、细胞学、古生物学、生物化学等各种性状），范围要尽可能宽，至少需要50个，最好100个以上。③全面计算相似性S。 方法是把一个OTU与另外的每个OTU作比较，通常用百分比来表示。S为百分之百表示完全一致，S为百分之零则表示没有相似。然后把每个OTU的S系数列成一个相似性表或矩阵。④进行“簇分析”。把相似性矩阵加以重排，把那些彼此有高度相似性的OTUs集在一起，形成“簇”。将这些簇分阶层地排成树状图，就可以根据具体情况选择不同的相似性水平来代表不同的等级。⑤判别。分类完成后，再倒回去重新检查一下性状，将最稳定的性状作为检索表的特征。数量分类学的方法采用的性状数量多，用计算机运算速度快，所得的结果比较客观。起初用于细菌和病毒等微生物的分类，后来又扩展到高等动植物的分类研究。