生物控制论（biocybernetics），控制论的分支学科。应用控制论的思想和方法研究生物系统的调节、控制和信息处理规律的学科。生物控制论不仅可定性地确定生理和病理机制，而且着重从系统的、定量的、动态的角度研究生物系统。生物反馈系统的定量的和动态的研究，是生物控制论的重要内容。建立描述各种生物系统的控制和信息处理过程的繁简不同的数学模型并进一步加以分析或进行系统仿真，是生物控制论的主要方法。应用现代控制理论中的系统辨识方法可以获得生物系统的参量。由于生物体的特性有个体差别和随时间变化的特点，这些参量可以反映个体的特征，为精确的诊断和最优治疗提供依据。神经元与神经网络的研究是生物控制论研究的另一重要内容。对于感觉系统中信息传递、编码和加工等过程的模型和分析已有了较深入的研究。这些研究构成生物控制论的重要分支——神经控制论的主要内容。

生物控制论除了用来阐明生物系统的机理外，还可应用于解决医学中的实际问题。例如应用最优控制理论确定药物和放射疗法的最优方案，用自适应控制方法保证手术病人血压的稳定，合理设计生物电控制假肢和解决人工脏器的控制问题等。从生命控制论的观点来看，生命控制系统是极其复杂的多层次的容错的自组织系统。现在仅在机体水平上进行了一些研究，其他各结构层次上的控制和调节的内在机制尚待作进一步的定量的与动态的研究。利用生物控制论的研究成果，促使医疗保健向纵深方向发展，特别是利用生物反馈的方法来防治某些神经精神性疾病，也是完全可能的。应用生物控制论的原理和方法揭开生命之谜，这是当代最重要的研究课题之一。