衣原体属（Chlamydia），原包括多种衣原体，现在分别划到衣原体门的几个科中，本属仅保留沙眼衣原体等两个种。

下属物种

本属包括以下物种：

• 鸟衣原体 Chlamydia avium Sachse et al., 2015
• 家禽衣原体 Chlamydia gallinacea Sachse et al., 2015
• 鼠型沙眼衣原体 Chlamydia muridarum Everett et al., 1999，鼠沙眼衣原体
• 猪衣原体 Chlamydia suis Everett et al., 1999
• 沙眼衣原体 Chlamydia trachomatis (Busacca, 1935) Rake, 1957