茨藻科（汉语拼音：Cizao Ke；英语：Najadaceae），单子叶植物纲泽泻亚纲的一科。

1年生沉水性草本，茎细多分枝。叶互生，对生或轮生，常线形，有齿，基部有鞘。花单性，单生叶腋，雄花花梗基部通常有鞘状苞，花被透明，仅一雄蕊，花药一或四室，雌花有一雌蕊，裸出，或有膜质花被状物，子房上位，柱头2～3，线形。坚果状。

仅茨藻属1属约50种，广布于全球淡水或咸水中，中国约有4种，生于各地。较常见的为沉生淡水的茨藻和草茨藻，前者叶条形，扁平，缘有粗齿牙，后者叶针形，有稍多数的微细齿牙，此类植物无经济价值，仅有时可育于水族箱中。本科区别于眼子草科处，为一年生草本，花常完全沉生水中（不飘浮在水面），胚珠直立于子房基底。